福建省农业科学院成立于1960年。现设有水稻、茶叶、果树、作物、甘蔗、食用菌、畜牧兽医、生物技术、农业生态、植物保护、土壤肥料、农业生物资源、农业工程技术、农业经济与科技信息等研究所和中心实验室以及科技干部培训中心共16个研究（服务）机构。
　　拥有国家水稻改良中心福州分中心等3个国家级重点实验室（中心），福建省精密仪器农业测试重点实验室等6个省级重点实验室，福建省畜禽疫病防治工程技术研究中心等12个省级工程（技术）研究中心；建有国家龙眼-枇杷资源圃、福建省农业科研野外观察站等8个国家和省级资源圃和野外观察站。全院共有142多公顷实验场（圃），保存珍贵作物种质资源13000多份。
　　在职职工1090人，其中，中国科学院院士1人、国家级专家6人、省级专家15人、享受国务院政府特殊津贴73人、国家“百千万人才工程”人选5名、省“百千万人才工程”人选37名；研究员120人，副研究员221人，中级专业技术人员317人；博士（生）108人、硕士（生）381人。建立了博士后科研工作站和中农院研究生教学实习基地，每年合作招收硕士、博士研究生100人左右。1978-2010年以来，共取得国家、部省级科技奖励成果385项，其中省部级二等奖以上重大成果104项。
    我院坚持服务“三农”，服务企业，近年来实施“双百”行动，每年选派百名农业专家深入基层服务百家农业龙头企业,选派百名农业专家驻点农村服务百个规模经营的专业农户。建立了200多家农业龙头企业技术示范点和300多个规模种植科技示范基地，探索出农业科技服务“三农”长效机制，有效推进了科技成果的转化应用。

    我院坚持以应用研究和开发研究为主，适当开展基础研究，建立了作物育种、园艺科学、农业微生物、农业生态、动物传染病、基础生物学、植物保护、农产品加工、农村区域经济、食用菌等10个创新团队，着力提高科技创新能力。在水稻育种（超级稻、转基因水稻）、果树育种（枇杷、龙眼）、畜禽疫苗（番鸭细小病毒病）、水产病害（欧鳗小瓜虫）、生物农药（生物杀菌剂-ANTI8098A和生物杀虫剂-BtA）、植物病虫防治（捕食螨、柑桔黄龙病）、农业生态（红萍资源）等方面研究居世界先进水平。